Ciencia reproducible

Qué es la ciencia reproducible

  • Definición de ciencia abierta

Recursos para ciencia abierta

  • U de Arizona. Training. Link.
  • MANTRA, free online course for those who manage digital data as part of their research project. Link.
  • NASA Open Science 101. Link, Link, GIT

Cómo crear una propuesta para el de manejo de datos

Un plan de gestión de datos (DMP) es un documento que describe cómo tratará sus datos durante un proyecto y qué sucede con los datos una vez finalizado el proyecto. Dichos planes generalmente cubren todo o parte del ciclo de vida de los datos, desde el descubrimiento, la recopilación y la organización de datos, hasta el aseguramiento de la calidad / control de calidad, la documentación y el uso de la información (Michener, 2015).

  • Ten Simple Rules for Creating a Good Data Management Plan. PloS. 2015. Link.
  • IPBES Data Management Tutorials. Link.

Publicación reproducible

Quarto

  • What is Quarto. Link.
  • Quarto Guide. Link.***
  • Slides. Reproducible Publications w/ Python and Quarto. Tom Mock. Link
  • Resources nrennie. Link.
  • Posit workshops. Link.
  • Isabella Velasquez. Link
  • Quartificate is to transform Google Docs into Quarto books. Link.
  • Awsome Quarto. The most up to date curated list of Quarto® docs, talks, tools, examples & articles the internet has to offer. Link
  • Reproducible, dynamic, and elegant books with Quarto. Mine Centinkaya. Link

Reproducible Manuscripts with Quarto - posit::conf(2023)

Get started with Quarto | Mine Çetinkaya-Rundel

Publishing a Quarto website through GitHub Pages (updated)

BioC 2022 - Hello, Quarto!

Welcome to Quarto Workshop! | Led by Tom Mock, RStudio

Introducing Positron, a new data science IDE - posit conf 2024

Quarto blogs

Quarto books

Citaciones

Videos sobre Quarto pub

Myst and Curvenote

  • Curvenote. Link
  • AGU Notebooks. La Palma Seismicity 2021. Link

Shiny

Shiny

Markdown

Markdown es un lenguaje de marcado ligero que permite añadir elementos de formato a documentos de texto sin formato. Creado por John Gruber en 2004, Markdown es actualmente uno de los lenguajes de marcado más populares del mundo. Markdown se puede usar para todo. Se usa para crear sitios web, documentos, notas, libros, presentaciones, correos electrónicos y documentación técnica. Markdown es independiente de la plataforma.

  • Markdown Guide Org. Link ***
  • The Markdown Guide. Link.
  • Markdown Cheatsheets. Link
  • Rich content editors. Link

Static site generators

  • Mkdocs. Project documentation with Markdown. Link.
    • Materials for Mkdocs. Link.
  • Sphinx. Link.
  • Jekyll. Link
  • Fast Api. Link.
  • MyST. Link.
  • Quarto. Link
  • Books
  • Awesome Static Web Site Generators. Link.
  • Introduction to Static Site Generators. Link.
  • How to choose the right static site generator. Link.
  • The top five static site generators for 2025. Link.

How To Create STUNNING Code Documentation With MkDocs Material Theme

Material for MkDocs: Full Tutorial To Build And Deploy Your Docs Portal

SciPy Proceedings 2025. MyST Markdown and Curvenote

Diagramas

Mermaid

Graphviz

flowchart LR
  A[Hard edge] --> B(Round edge)
  B --> C{Decision}
  C --> D[Result one]
  C --> E[Result two]